Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Fam220aQ3ZN08 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Fam220aQ3ZN08 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Fam220aQ3ZN08 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Fam220aQ3ZN08 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam220aQ3ZN08 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Fam220aQ3ZN08 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam220aQ3ZN08 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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