Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms