Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms