Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

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Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnah12Q3V0Q1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnah12Q3V0Q1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnah12Q3V0Q1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnah12Q3V0Q1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnah12Q3V0Q1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnah12Q3V0Q1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnah12Q3V0Q1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnah12Q3V0Q1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnah12Q3V0Q1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnah12Q3V0Q1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnah12Q3V0Q1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnah12Q3V0Q1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnah12Q3V0Q1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms