Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bbof1Q3V079 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bbof1Q3V079 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms