Protein–RNA interactions for Protein: Q3V053

4933427I04Rik, Riken cDNA 4933427I04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933427I04RikQ3V053 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933427I04RikQ3V053 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933427I04RikQ3V053 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933427I04RikQ3V053 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms