Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc160Q3UYG1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms