Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E330034G19RikQ3UWX6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms