Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn4Q3UV66 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms