Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trat1Q3UU67 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trat1Q3UU67 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms