Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chpf2Q3UU43 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chpf2Q3UU43 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms