Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT80

Gm1587, Predicted gene 1587, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1587Q3UT80 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm1587Q3UT80 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm1587Q3UT80 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm1587Q3UT80 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm1587Q3UT80 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm1587Q3UT80 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm1587Q3UT80 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm1587Q3UT80 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm1587Q3UT80 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms