Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc190Q3URK1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc190Q3URK1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms