Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp560Q3URI6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp560Q3URI6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp560Q3URI6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp560Q3URI6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp560Q3URI6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp560Q3URI6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp560Q3URI6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp560Q3URI6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp560Q3URI6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp560Q3URI6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp560Q3URI6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms