Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam198bQ3UPI1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam198bQ3UPI1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam198bQ3UPI1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam198bQ3UPI1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam198bQ3UPI1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam198bQ3UPI1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam198bQ3UPI1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam198bQ3UPI1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam198bQ3UPI1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam198bQ3UPI1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam198bQ3UPI1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam198bQ3UPI1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam198bQ3UPI1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam198bQ3UPI1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam198bQ3UPI1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam198bQ3UPI1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam198bQ3UPI1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam198bQ3UPI1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms