Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Washc4Q3UMB9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms