Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc61Q3UJV1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms