Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sf3b2Q3UJB0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms