Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm648Q3UJ22 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm648Q3UJ22 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms