Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf10Q3UIW5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf10Q3UIW5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms