Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Greb1Q3UHK3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms