Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Zswim8Q3UHH1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zswim8Q3UHH1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms