Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
LchnQ3UHG7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LchnQ3UHG7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LchnQ3UHG7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms