Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp8Q3UD82 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp8Q3UD82 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms