Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pid1Q3UBG2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pid1Q3UBG2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 532.8 ms