Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam193bQ3U2K0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms