Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc174Q3U155 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc174Q3U155 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc174Q3U155 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc174Q3U155 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc174Q3U155 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc174Q3U155 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc174Q3U155 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc174Q3U155 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc174Q3U155 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc174Q3U155 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc174Q3U155 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms