Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hace1Q3U0D9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms