Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl4Q3TZA2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl4Q3TZA2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl4Q3TZA2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl4Q3TZA2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl4Q3TZA2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl4Q3TZA2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl4Q3TZA2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl4Q3TZA2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl4Q3TZA2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl4Q3TZA2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl4Q3TZA2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl4Q3TZA2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl4Q3TZA2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl4Q3TZA2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.9 ms