Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn4clQ3TYX2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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