Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc28Q3TX51 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms