Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3TTJ4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms