Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cwc27Q3TKY6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cwc27Q3TKY6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms