Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2afvQ3THW5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms