Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms