Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms