Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna5Q2MKA5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chrna5Q2MKA5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms