Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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