Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo3bQ1EG27 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Myo3bQ1EG27 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms