Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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