Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpusd2Q149F1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms