Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Perm1Q149B8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Perm1Q149B8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms