Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VgfQ0VGU4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms