Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rundc1Q0VDN7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms