Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tigd2Q0VBL1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd2Q0VBL1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms