Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap5cQ0V8T7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms