Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spata18Q0P557 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spata18Q0P557 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spata18Q0P557 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms