Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r181Q0P547 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms