Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TrioQ0KL02 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms