Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms